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Großer Kinderkrebs-DNA-Katalog veröffentlicht
Mit der Veröffentlichung eines umfangreichen Katalogs von vollständigen DNA-Daten über Krebs bei Kindern an die weltweite wissenschaftliche Gemeinschaft hofft ein Team des St. Jude Kinderforschungskrankenhauses in Memphis, Tennessee, den Fortschritt bei der Suche nach Ursachen und neuen Behandlungen für Krebs und andere zu beschleunigen Krankheiten.
Der Katalog enthält vollständige Genomsequenzen, im Wesentlichen vollständige DNA-Karten, von 260 Krebspatienten. Es gibt insgesamt 520 Sequenzen, die übereinstimmende Sätze von normalen und Tumorgewebeproben umfassen.
Die Wissenschaftler, die die Daten veröffentlichen, arbeiten am Pediatric Cancer Genome Project der Universität Washington, das bis Ende dieses Jahres mehr als 1.200 Genome sequenzieren soll.
Die Veröffentlichung, die als die bisher größte ihrer Art für die wissenschaftliche Gemeinschaft gilt, wurde im Rahmen eines in Naturgenetik am Dienstag.
Um eine maximale Genauigkeit der Daten sicherzustellen, wird jede Probe 30-mal sequenziert.
Die Informationen werden nicht nur für Forscher auf dem Gebiet der Krebsforschung wertvoll sein, sondern auch für Wissenschaftler, die alle Arten von Krankheiten untersuchen.
Forscher in St. Jude versuchen, die Unterschiede zwischen den Genomen von gesunden und Krebszellen zu identifizieren, um die Ursachen von mehr als einem halben Dutzend tödlicher Kinderkrebsfälle zu identifizieren.
Ihre Arbeit hat bereits einige wichtige Entdeckungen hervorgebracht, über die sie in führenden wissenschaftlichen Zeitschriften geschrieben haben.
Einige dieser Entdeckungen enthalten wichtige Einblicke in aggressive Kinderkrebsarten der Netzhaut, Hirnstamm und Blut. Bei der Untersuchung der Frage, was hinter der schnellen Entwicklung des Augentumors Retinoblastom steckt, identifizierten die Projektforscher beispielsweise ein neues viel versprechendes Mittel gegen Krebs.
In einem anderen Teil des Projekts entdeckten Wissenschaftler, die eine tödliche Leukämie im Kindesalter, ETP-ALL (Abkürzung für frühe akute lymphoblastische T-Vorläufer-Leukämie), untersuchten, unerwartete Genomunterschiede, die die Diagnose und Behandlung von Kindern mit dieser Krankheit verbessern könnten.
James Downing ist wissenschaftlicher Leiter von St Jude und Leiter des Projekts in St. Jude. Er sagte der Presse, diese Ergebnisse und andere wären ohne das Pediatric Cancer Genome Project nicht möglich gewesen und:
"Indem wir die Informationen teilen ... hoffen wir, dass andere Forscher diese reiche Ressource für Einsichten in viele andere Arten von Krankheiten bei Kindern und Erwachsenen nutzen können", sagte er.
Das Pediatric Cancer Genome Project ist anders, da es im Gegensatz zu vielen Genomprojekten ganze Genom-Datensätze produziert, die ganze DNA-Sequenzen zeigen, anstatt sich auf einzelne Gene zu konzentrieren.
Solche Datensätze geben ein viel umfassenderes Bild der DNA-Veränderungen hinter den Ursachen und dem Fortschreiten der Krankheit.
Richard K Wilson, Direktor des Genome Institute an der Washington University School of Medicine in St. Louis, sagte mit diesem Ansatz, dass sie ungewöhnliche "kryptische" Veränderungen in den Krebszellen vieler Patienten gefunden haben, die sie mit anderen Methoden nicht gefunden hätten.
Das Projekt hat auch gezeigt, dass es einige markante Unterschiede zwischen Krebserkrankungen bei Kindern und Erwachsenen gibt, was unterstreicht, warum es wichtig ist, für jeden eine separate Behandlung zu entwickeln.
Die Forscher können online auf die Daten zugreifen, indem sie eine Anfrage an das Europäische Genom-Phenom-Archiv stellen.
Geschrieben von Catharine Paddock
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