Die geographischen Ursprung der Leute zurückführbar mit neuer genetischer Methode

Haben Sie sich jemals eine Weltkarte angesehen und sich gefragt, woher Ihre Vorfahren kommen? Nun, vielleicht ist es möglich, herauszufinden, nur durch die Entnahme Ihres Genoms, dank eine neue genetische Methode, die von Forschern in den USA und Israel entwickelt wurde und die geografische Herkunft eines Menschen bestimmen kann.
Das Team der University of California - Los Angeles (UCLA) der Henry Samueli School of Engineering and Applied Science, der Abteilung für Ökologie und Evolutionsbiologie der UCLA, und der Tel Aviv University, schreibt in einer online veröffentlichten Arbeit über ihre Arbeit Naturgenetik am 20. Mai.
Die Forscher hoffen, dass ihre Methode, die sie "räumliche Abstammungsanalyse" oder SPA nennen, das Verständnis der genetischen Vielfalt unter den Populationen erhöhen wird, was wiederum hilft, menschliche Krankheiten und Evolution besser zu verstehen.
Zu den Forschungsgebieten, die von der neuen Methode profitieren könnten, gehören das Auffinden von Verbindungen zwischen genetischen Varianten und Krankheiten und das Auffinden von Teilen von Genomen, die einer positiven Selektion unterzogen wurden.
SPA ist ein Software-Tool zur Analyse der räumlichen Struktur genetischer Daten. Es modelliert Genotypen im zwei- und dreidimensionalen Raum.
Mit SPA können Forscher die räumliche Verteilung jeder genetischen Variante modellieren. Und in dieser Studie zeigte das Team, dass bestimmte Frequenzmuster der räumlichen Verteilung von Genvarianten an bestimmte geografische Orte gebunden sind.
Für genetische Varianten verwendete das Team SNPs ("Snips", kurz für Einzelnukleotid-Polymorphismen) aus verschiedenen Teilen des Genoms, einschließlich "der gut charakterisierten LCT-Region, sowie an Loci einschließlich FOXP2, OCA2 und LRP1B".
Ein SNP ist eine DNA-Sequenzvariation, bei der ein einzelner Nukleotidunterschied (A, T, C oder G) in der "Schreibweise" der Sequenz besteht.
Co-Autor Eleazar Eskin ist Associate Professor für Informatik an der UCLA Engineering. Er sagte der Presse:
"Wenn wir wissen, woher jedes Individuum in unserer Studie stammte, beobachten wir, dass manche Variation in einem Teil der Welt häufiger und in einem anderen Teil der Welt weniger verbreitet ist."
Eskin und Kollegen entwickelten die SPA-Software als ein "einfaches probabilistisches Modell", das die Häufigkeit, mit der sich eine genetische Variante als Funktion der geographischen Lage des Individuums verändert, aufzeichnet. Mit anderen Worten, die Genfrequenz ist eine Funktion der x- und y-Koordinaten eines Individuums auf einer Karte.
Sie fütterten genetische Variation und geografische Standortdaten aus einer europäischen und einer weltweiten Sammlung von Individuen in das Modell.
Aus diesem Grund fanden sie heraus, dass sie in der Lage waren, Individuen auf der Grundlage ihrer genetischen Informationen auf einer Weltkarte zu platzieren, was zeigt, dass man die Häufigkeit genetischer Variation als an einen bestimmten Ort in der Welt gebunden betrachten kann.
Eskin sagte, dies gebe uns eine andere Denkweise über die Bevölkerung. Anstelle von Vorfahren mit diskreten Eigenschaften, sehen Sie es als ein "Kontinuum":
"Wenn man an die Herkunft einer Person denkt, geht es nicht mehr darum, aus einer bestimmten Bevölkerung zu kommen - sondern die Herkunft einer Person wird durch den Ort bestimmt, von dem sie kommen", erklärte er.
Der Erstautor Wen-Yun Yang, Absolvent der UCLA-Informatik, erklärte, wie das Modell dann nützlich sein kann:
"Wenn der Aufenthaltsort eines Individuums unbekannt ist, kann unser Modell tatsächlich auf geografische Ursprünge für jedes Individuum schließen, wobei nur deren genetische Daten mit überraschender Genauigkeit verwendet werden."
Co-Autor John Novembre, ein Assistant Professor an der UCLA Abteilung für Ökologie und Evolution, sagte:
"Das Modell ermöglicht es, die geographische Herkunft der Eltern eines Individuums abzuleiten, selbst wenn diese Eltern unterschiedliche Vorfahren haben. Bestehende Ansätze schwanken, wenn es um diese Aufgabe geht."
Die Forscher schlagen auch vor, dass das Modell eine Methode zur Verfügung stellt, um Gene zu finden, die beim Menschen selektiert werden.
Die National Science Foundation und die National Institutes of Health leisteten finanzielle Unterstützung für die Studie.
Geschrieben von Catharine Paddock

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